唐僧师徒西天取经回到长安，大唐皇帝率满朝文臣武将出城相迎，万民欢腾，热闹非凡。师徒们来到灵山，如来佛祖一一分封，各得其所，安居乐业。
不料五百年后，天昏地暗，魔头无天突然降临，佛祖圆寂，三界大乱。
无天向众妖宣称：如来并未涅磐，只是真性投到人间，三十三年后还会借着转世灵童的法身托生，倚仗十七颗舍利子夺天地造化，法力无边；若要永久占领天庭统治世界，必须利用孙悟空找到十七颗舍利子，杀死转世灵童。　　
被无天押在冥界的唐僧，识透无天的野心和阴谋，深知只有悟空才能消灾解难，便念起紧箍咒。正在花果山与师弟八戒闲聊的悟空得知师傅有难，二人驾云出山，一路上但见林木萧索，人迹稀罕，顿觉大事不妙，调转云头来到冥界，得到师傅点化，去凡间寻找转世灵童。
转世童乔灵儿已经长成一个丰神俊秀的年轻人，这天正为祖父祝寿庆喜，几个红衣女子簇拥着一个白衣女子闯进院子，立逼乔家拿出粮草钱财。她们原是一伙匪徒，白衣女子便是匪首白莲花。灵儿当场斥责她们的强盗行径，莲花大怒，将灵儿绑上山寨，断水断食。灵儿宁死不屈，莲花反倒深受感动，直抒自己的爱慕之情。奄奄一息的灵儿含笑死去，被一只巨鹰将尸身叼走。
悟空和八戒来到双塔寺，寺院突然坍塌，悟空意外地在废墟中捡到一颗舍利子，被俯冲过来的巨鹰夺走，悟空与八戒驾云追到凤头山，只见灵儿口中正含着那颗舍利子苏醒过来。
无天得知悟空找到转世灵童，即命黑袍护法带二金刚前去抢夺，身在冥地的唐僧又气又急，纵身跃出轮回隧道，途遇哪吒，二人同去寻找悟空。
悟空与八戒将灵儿带回花果山，黑袍现出百丈巨蟒原身将山围住，适逢唐僧领哪吒到来，哪吒现出三头六臂将二金刚击毙。黑袍带伤跑回灵山报信，无天下令各路妖魔一齐出动剿灭花果山，企图夺回灵童。
唐僧与悟空、哪吒将灵儿转到蓬莱仙岛，交碧游仙子看护。碧游与灵儿相处十分融洽，终于向灵儿吐露衷肠。灵儿对她虽有朦胧爱意，但却难忘莲花，无奈离开蓬莱在世间四处漂泊，不幸被黑袍所获。无天使用黑莲圣火煅杀灵儿，竟无法伤其分毫，无天终于明白，必须得到十七颗舍利子才能得逞，于是令黑袍务必在三十三天内将十七颗舍利子全部找到。
悟空等历尽千辛万苦找到十六颗舍利子，不慎误中黑袍埋伏，悟空急将舍利子一口吞下，被无天生擒，置于沸鼎之内，意欲用圣火烧化，炼出舍利子。八戒历尽险阻，识破鬼怪所设机关诡计，击杀拦路的怪兽，从沸鼎救出悟空。唐僧师徒汇合，与无天展开一场生死决战。
距离如来返回只有一个时辰，众圣虽奋力拼搏，仍难取胜。悟空得知自己就是制服无天的第十七颗无骨舍利子时，毅然跳入火海，化为一颗斗大的舍利子向无天击去。巨响声中，无天身形化作纸鸢飞逝，如来终于现出金身重归天庭，悟空打坐莲台含笑合十异常安祥。